魚病知識：抗菌肽分類 |
| 出處：水生動物健康評估 作者： 水產養殖網 2019-01-21 11:04:00 |
抗菌肽，因其天然的抗菌、抗病毒等活性而逐漸引起大家的重視，特別是在“耐藥”頻發的年代，甚至有文章描述抗菌肽有取代抗生素的潛力，今天小編給大家分享一下來源于抗菌肽數據庫中對抗菌肽的分類：
1、基于合成方式分類
天然抗菌肽可分為基因合成和非基因合成，抗菌肽數據庫最初只關注于基因合成類抗菌肽，也被稱為真抗菌肽。但目前一部分非基因合成類抗菌肽已經在臨床上得以應用，如多粘菌素、短桿菌肽、達托霉素。
2、基于生物來源分類
基于生物來源，抗菌肽分為細菌性抗菌肽、植物性抗菌肽、動物性抗菌肽。細菌性抗菌肽來源于細菌，來源于革蘭氏陽性菌的抗菌肽可分為以下幾類：I型，多肽鏈合成后發生化學性修飾，又細分為A型和B型，A型具細長結構，B型具球形結構；II型，多肽鏈合成后未經修飾，又細分為a、b、c、d型；III型，是具有裂解作用的大分子蛋白。來源于革蘭氏陰性菌的抗菌肽稱為microcins，根據分子量大小分為3種：I型（<5kDa）、II型（5-10kDa）、III型（>10kDa）。動物性抗菌肽又分為昆蟲抗菌肽、兩棲類抗菌肽、魚類抗菌肽、爬蟲類抗菌肽、哺乳類抗菌肽，其中基于來源家族不同，研究較為廣泛的是cathelicidins, defensins, histatins。
3、基于生物功能分類
基于抗菌肽的生物學功能可分為以下類型：抗菌肽（2565種）、抗生物膜肽（38種）、抗甲氧西林金黃色葡萄球菌肽（138種）、抗病毒肽（186種）、抗HIV肽（109種）、抗真菌肽（1090種）、抗蟲肽（103種）、抗瘧肽（25種）、抗原生動物肽（4種）、抗癌/腫瘤肽（224種）、抗氧化肽（23種）、趨向肽（60種）、殺蟲肽（33種）、蛋白抑制肽（28種）、殺精肽（13種）、表面固定肽（47種）、傷口愈合肽（19種）、抗毒肽（14種）、離子通道抑制肽（5種）、消炎肽（12種）。
4、基于肽的性能分類
在缺乏3D結構信息時，抗菌肽基于其電荷、疏水性、氨基酸組成、長度等性能分類?；诎被峤M成，稱為富含某氨基酸抗菌肽，如Trp-rich AMPs（富含色氨酸抗菌肽）?；陔姾煽煞譃檎?、中性、負電抗菌肽?；谑杷钥煞譃槭杷?、兩性、親水性抗菌肽?；诳咕牡拇笮。窗被岬臄的浚┛煞譃槌炭咕模?-10個氨基酸）、短抗菌肽（10-24個氨基酸）、中等抗菌肽（25-50個氨基酸）、長抗菌肽（50-100個氨基酸），氨基酸個數大于100個稱為抗菌蛋白。
5、基于共價鍵模式分類
基于共價鍵模式分類是抗菌肽分類的通用系統，可分為以下4類：
（1）UCLL型：線性單一肽鏈或者兩個不通過共價鍵連接的線性肽
（2）UCSS型：支鏈-支鏈相連肽
（3）UCSB型：支鏈-主鏈相連多肽
（4）UCBB型：多肽N端和C端相連成一環狀肽
6、基于3D結構分類
基于抗菌肽二級結構可分為α，β，αβ和 non-αβ 4種類型，α螺旋結構、β折疊結構、α螺旋+β折疊結構、無α螺旋和β折疊結構。
7、基于分子靶點分類
基于抗菌肽作用的分子靶點，可分為作用于細胞表面抗菌肽、作用于細胞內抗菌肽。
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